“El Titán” se convertió en ídolo de Boca Juniors, entre tantas cosas, por convertirle tantas veces a River Plate.
El último gol que convirtió en un Superclásico, en un partido en el que Boca triunfó por 2 a 0 por la 14ª fecha del Torneo Clausura 2011.
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El gol que le marcó desde afuera del área en un encuentro que finalizó 1 a 1 correspondiente a la 10ª fecha del Torneo Clausura 2009.
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Uno de los primeros goles que Martín Palermo le convirtió a River Plate con la camiseta de Boca Juniors se lo marcó el 11 de abril de 1998, en encuentro que ganó el Xeneize por 3 a 2, cuando aprovechó un rebote de Roberto Bonano, tras un remate desde afuera del área de Norberto Solano.
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«El Titán» se caracterizó por convertir goles muy llamativos y uno de ellos fue el que marcó desde 40 metros de cabeza a Vélez Sarsfield, que le permitió a Boca ganar por 3 a 2 por la 7ª fecha del Torneo Apertura 2009.
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Gol agónico y bajo una tormenta que convirtió ante Perú en el estadio Monumental para la Selección Argentina que por entonces dirigía Diego Maradona y que encaminó la clasificación para el Mundial de Sudáfrica 2010.
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Diego Maradona no sólo convocó a Martín Palermo para el Mundial de Sudáfrica sino que además le dio la oportunidad de jugar contra Grecia, por la última fecha de la primera ronda. «El Titán» respondió con goles.
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Luego de una lesión de ligamento cruzado que lo mantuvo afuera de las canchas por 193 días, el 24/05/2000 «El Titán» convertía el tercer gol de Boca Juniors frente a River Plate por el partido de vuelta de los cuartos de final de La Copa Libertadores 2000.
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